Network
Pasca gantung sepatu, Thomas memulai karirnya sebagai pelatih dan dipercaya menahkodai tim cadangan dari Hamburger SV di tahun 2002.
Kala menjadi pelatih Hamburger SV, Thomas telah menyelamatkan timnya dari jurang degradasi dan menyabet Piala Intertoto.
Pada tanggal 19 Mei 2008, Thomas mengundurkan diri dari Borussia Dortmund kala timnya itu mendapat hasil buruk dan hanya mampu bertengger di posisi ke -13.***
